Lối chơi của Age of Sail II có bản đồ nhỏ, người cầm lái và danh sách các tàu đang chơi. Người chơi điều khiển một hoặc nhiều bình mỗi bình với một số khẩu pháo, sức khỏe và buồm cụ thể. Ngoài ra còn có các điều khiển tốc độ của trò chơi.

Nhằm giành lấy chiến thắng, người chơi phải khiến tàu địch đầu hàng, hoặc đơn giản là đánh chìm chúng. Thiệt hại gây ra cho tàu được xác định theo loại phát bắn (đạn vòng, đạn dây xích, đạn bi, đạn hộp) và mục tiêu (thân tàu/cánh buồm). Mỗi đám cháy cũng gây ra thiệt hại cho thủy thủ đoàn. Phát bắn Canister được chế tạo đặc biệt nhằm gây sát thương cho các thành viên thủy thủ đoàn đối địch. Càng ít người trên tàu, cơ hội đầu hàng của tàu càng cao. Tốc độ của các hoạt động như điều động buồm, sửa chữa thiệt hại và tốc độ nạp đạn của pháo cũng bị ảnh hưởng.

Trò chơi đã bị giới phê bình cho rằng có giao diện quá phức tạp và đôi khi bị hỏng hoàn toàn, với sự phức tạp không cần thiết khi chỉ đạo các đội thực hiện các hành động khác nhau để giữ cho một con tàu hoạt động. Game engine 3-D cũng bị chỉ trích, đôi khi chạy chậm đến bốn khung hình/giây trong các hành động hạm đội lớn.[2][3]